全自動微波消解儀可對各種地表水、生活污水、工業廢水中化學需氧量（CODcr）、總磷（TP）、總氮（TN）、進行快速消解測定。微波消解儀廣泛用于各級環保部門，水資源管理部門及公共衛生部門對水質的鑒定與管理。
微波有機合成以其應用優勢將取代傳統的合成方法。諸如原子吸收光譜儀原子熒光光譜儀，電感耦合等離子體發射光譜儀電感耦合等離子體質譜聯用儀液相色譜儀，氣相色譜儀等分析儀器的樣品制備，越來越多的實驗室采用了微波樣品處理系統來替代耗時、費力、污染嚴重的方法。
全自動微波消解儀是如何工作的，可以先從物質與微波的作用方式開始。物質與微波的作用方式可以分為三類：導體反射微波，絕緣體透過微波，電介體吸收微波。微波消解儀的消解罐材質都是絕緣體方便微波透過，然后其中的酸試劑（電介體）可以吸收微波并被加熱。微波消解儀中的微波由腔體中的磁控管產生。
微波化學式建立在通過微波介電加熱效應的基礎上來有效加熱物質的。介電加熱時通過兩種主要機理來加熱的。
偶極極化：能夠在微波輻射下產生熱的物質要具有偶極矩，當施加電場發生震蕩時，偶極場在交流電場中進行重排。在這一過程中，由于分子間的摩擦和介電損失，能量以熱的形式被消耗。
離子傳導：在離子傳導過程中，樣品中溶解的帶電粒子在微波場的影響下前后震蕩，與其鄰近的分子或原子碰撞，碰撞引起攪動或運動，便形成了熱。在介電加熱中，電磁能首先轉化為動能，然后轉化為熱能。
